生殖顆粒是特異性存在于動(dòng)物生殖細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中的無(wú)膜細(xì)胞器(MLOs),參與多種RNA相關(guān)的代謝過(guò)程,包括小RNA加工、mRNA儲(chǔ)存、mRNA翻譯和降解等。在哺乳動(dòng)物雄性生殖細(xì)胞中存在著一類位于線粒體簇之間的生殖顆粒,被稱為intermitochondrial cement(IMC)。piRNA是一種在生殖細(xì)胞中特異性表達(dá)的小非編碼RNA,與 PIWI蛋白結(jié)合形成復(fù)合物通過(guò)抑制轉(zhuǎn)座子、調(diào)節(jié)基因表達(dá)等機(jī)制促進(jìn)精子發(fā)生的正常進(jìn)行。IMC的組分中包含大量與piRNA生成有關(guān)的蛋白,因此IMC被認(rèn)為是piRNA加工的主要場(chǎng)所。哺乳動(dòng)物生殖細(xì)胞中IMC的形成對(duì)于piRNA生成以及精子發(fā)生至關(guān)重要,然而目前對(duì)于IMC的形成機(jī)制一直未知。研究表明,相分離(phase separation)通過(guò)生物大分子(包括蛋白質(zhì)、RNA、DNA等)之間的多價(jià)相互作用形成大分子凝聚物,在細(xì)胞中促進(jìn)多種無(wú)膜細(xì)胞器的形成。在果蠅、線蟲(chóng)以及斑馬魚的生殖細(xì)胞中,相分離參與多種生殖顆粒的組裝。但是,相分離是否參與哺乳動(dòng)物生殖顆粒的組裝還不清楚。
2024年7月18日,同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院丁德強(qiáng)教授團(tuán)隊(duì)在Developmental Cell上在線發(fā)表題為TDRD1 phase separation drives intermitochondrial cement assembly to promote piRNA biogenesis and fertility的文章。該研究揭示了TDRD1蛋白通過(guò)相分離活性驅(qū)動(dòng)IMC組裝的分子機(jī)制,并證明相分離驅(qū)動(dòng)的IMC組裝對(duì)于piRNA的生成、轉(zhuǎn)座子沉默以及雄性生殖細(xì)胞發(fā)育至關(guān)重要。

已知TDRD1蛋白定位于雄性生殖細(xì)胞的IMC中,TDRD1缺失導(dǎo)致piRNA生成缺陷以及精子發(fā)生停滯【5】。為了研究TDRD1蛋白的分子功能,研究人員首先借助熒光漂白恢復(fù)實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞內(nèi)融合與分離實(shí)驗(yàn)以及體外純化蛋白的相分離實(shí)驗(yàn)證明TDRD1蛋白在細(xì)胞內(nèi)和體外具有相分離活性。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)TDRD1通過(guò)位于C端的coiled-coil超螺旋結(jié)構(gòu)域自我相互作用,并自組裝成四聚體來(lái)驅(qū)動(dòng)相分離活性。
通過(guò)一系列突變質(zhì)粒的篩選,研究人員鑒定出coiled-coil結(jié)構(gòu)域中的疏水氨基酸基序(1149ILLFLL1154)對(duì)于TDRD1的自我相互作用以及相分離活性至關(guān)重要。將疏水氨基酸基序突變后,TDRD1無(wú)法自我相互作用,從而失去相分離活性。除此之外,TDDR1蛋白包含4個(gè)串聯(lián)的Tudor結(jié)構(gòu)域。研究人員發(fā)現(xiàn)Tudor結(jié)構(gòu)域通過(guò)識(shí)別對(duì)稱精氨酸二甲基化修飾(sDMA)的蛋白,來(lái)促進(jìn)TDRD1發(fā)生相分離。因此,TDRD1通過(guò)coiled-coil結(jié)構(gòu)域的自組裝以及Tudor-sDMA相互作用來(lái)獲得多價(jià)相互作用,協(xié)同促進(jìn)TDRD1相分離活性。
為了研究TDRD1相分離活性在生殖細(xì)胞中的生理功能,研究人員制作了TDRD1相分離活性缺失突變小鼠。研究人員將TDRD1蛋白C端coil-coil結(jié)構(gòu)域中的疏水氨基酸基序ILLFLL突變成GSGSGS,使得TDRD1蛋白在生殖細(xì)胞中失去相分離活性。TDRD1相分離活性缺失突變小鼠雄性不育,其精子發(fā)生停滯在減數(shù)分離前期,無(wú)法產(chǎn)生成熟精子。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)TDRD1相分離活性缺失導(dǎo)致IMC無(wú)法組裝,piRNA生成量顯著下降,轉(zhuǎn)座子異常激活。這些結(jié)果證明了TDRD1相分離對(duì)于雄性生殖細(xì)胞中IMC的組裝以及功能發(fā)揮至關(guān)重要。
最后,研究人員發(fā)現(xiàn)TDRD1的相分離活性在脊椎動(dòng)物中具有很強(qiáng)的保守性,而在非脊椎動(dòng)物中并不保守。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)非脊椎動(dòng)物的TDRD1同源蛋白缺少C端coiled-coil結(jié)構(gòu)域,因此無(wú)法發(fā)揮相分離的活性。研究人員的這一發(fā)現(xiàn)解釋了為什么IMC在脊椎動(dòng)物生殖細(xì)胞中普遍存在,而在非脊椎動(dòng)物生殖細(xì)胞中卻并不顯著。
綜上所述,該研究揭示了TDRD1相分離活性的分子機(jī)制以及TDRD1相分離活性在生殖細(xì)胞中的IMC組裝、piRNA生成和轉(zhuǎn)座子沉默中的生理作用。該研究將相分離與哺乳動(dòng)物生殖顆粒的組裝聯(lián)系起來(lái),為研究生殖細(xì)胞中無(wú)膜細(xì)胞器的形成以及功能發(fā)揮提供了新的思路,對(duì)于進(jìn)一步理解哺乳動(dòng)物精子發(fā)生的調(diào)控機(jī)制具有重要意義。