2018年4月12日下午兩點(diǎn)，中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院應(yīng)用數(shù)學(xué)所王勇教授來我所進(jìn)行題為《解讀基因組的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建模》的學(xué)術(shù)報(bào)告。
王勇教授來自中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院應(yīng)用數(shù)學(xué)所, 是國家優(yōu)秀青年基金獲得者。1999 年獲內(nèi)蒙古大學(xué)數(shù)學(xué)系的數(shù)學(xué)物理專業(yè)學(xué)士學(xué)位，2002 年畢業(yè)于大連理工大學(xué)應(yīng)用數(shù)學(xué)系獲運(yùn)籌學(xué)與控制論碩士學(xué)位，2005年畢業(yè)于中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院獲得運(yùn)籌學(xué)與控制論專業(yè)的理學(xué)博士學(xué)位。曾先后到美國波士頓大學(xué)生物信息學(xué)中心，日本產(chǎn)業(yè)技術(shù)綜合研究所計(jì)算生物研究中心和美國斯坦福大學(xué)統(tǒng)計(jì)系從事訪問研究。他目前的研究方向是生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)建模。
報(bào)告指出：隨著測序技術(shù)的發(fā)展，可以期待在不久的將來，很多人都會有自身的全基因組測序數(shù)據(jù)，那么如何解讀人與人之間的幾百萬個基因組上特定位置的變異，特別是解釋復(fù)雜性狀和疾病相關(guān)的遺傳變異（包括單核苷酸多態(tài)（SNP）和結(jié)構(gòu)變異），將是一個有著非常重要意義卻又異常有挑戰(zhàn)性的問題。該問題的挑戰(zhàn)聚焦于對位于98%的非編碼調(diào)控區(qū)域的變異的注釋，即研究這些非編碼區(qū)域的位點(diǎn)機(jī)理層面怎么跟表型產(chǎn)生聯(lián)系。其中一個根本困難是基因調(diào)控的組織、條件特異性。即在特定的條件下，特定基因表達(dá)的啟動或停止，增強(qiáng)或抑制，是細(xì)胞選擇基因組中的調(diào)控元件和相互作用完成基本生命活動以及對外界刺激作出應(yīng)答的分子基礎(chǔ)。對其建模需要引入染色質(zhì)調(diào)控因子以及順式調(diào)控元件的開放狀態(tài)等因素，回答轉(zhuǎn)錄因子等反式調(diào)控因子和增強(qiáng)因子等順式調(diào)控元件在特定的細(xì)胞環(huán)境下怎么合作實(shí)現(xiàn)基因的時空特異表達(dá)這些挑戰(zhàn)性問題。
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